แต่เป็นเรื่องยากที่จะทำงานอย่างครอบคลุมเกี่ยวกับชีววิทยาและความรุนแรงของศัตรูพืช เนื่องจากยังไม่มีจีโนมที่ใช้การได้” Baum กล่าว “งานของเราเป็นก้าวสำคัญที่ช่วยให้สามารถค้นคว้าวิจัยใหม่ๆ ได้”
ดีเอ็นเอซ้ำพันธุศาสตร์ของไส้เดือนฝอยถุงถั่วเหลืองนำเสนอความท้าทายที่ทำให้นักวิทยาศาสตร์ไม่สามารถรวบรวมจีโนมแบบเต็มได้เป็นเวลาหลายปี ทีมวิจัยจัดลำดับจีโนมก่อนโดยจัดลำดับส่วนที่เล็กลง
จากนั้นจึงรวมส่วนเหล่านั้นเข้าด้วยกัน
เป็นจีโนมที่สมบูรณ์ ประมาณหนึ่งในสามของยีนทั้งหมด 29,769 ยีนของไส้เดือนฝอยนั้นมีลักษณะซ้ำๆ กัน ซึ่งหมายความว่ายีนจำนวนมากมีหลายชุด ริก เมสันบริงก์ นักวิทยาศาสตร์ร่วมของสำนักงานเทคโนโลยีชีวภาพของ ISU และผู้เขียนนำของการศึกษากล่าว เมสันบริงก์กล่าวว่า DNA ที่ซ้ำกันนั้นซับซ้อนอย่างมากในการจัดลำดับและขั้นตอนการประกอบ
Andrew Severin ผู้เขียนร่วมของการศึกษา
และผู้จัดการของ ISU Genome Informatics Facility เปรียบเทียบสิ่งนี้กับจิ๊กซอว์ของท้องฟ้าสีฟ้า ซึ่งชิ้นส่วนทั้งหมดมีรูปร่างและสีเหมือนกัน เป็นการยากที่จะเข้าใจว่าชิ้นส่วนซ้ำ ๆ เหล่านั้นเข้ากันได้อย่างไร Severin กล่าว แต่วิธีการที่เรียกว่าเทคโนโลยีการจัดลำดับการอ่านแบบยาวทำให้สามารถรวบรวมจีโนมคุณภาพสูงได้
ตอนนี้ จีโนมที่รวมตัวกันอย่างสมบูรณ์สามารถนำไป
สู่การพัฒนากลยุทธ์การจัดการศัตรูพืชที่ดีขึ้นได้ Baum กล่าว การมีจีโนมที่ประกอบอย่างสมบูรณ์อยู่ในมือจะทำให้นักวิทยาศาสตร์สามารถเปรียบเทียบประชากรไส้เดือนฝอยที่แตกต่างกันในระดับยีนได้
เมื่อไส้เดือนฝอยเข้าทำลายต้นถั่วเหลือง พวกมันต่อสู้กับการป้องกันตามธรรมชาติของถั่วเหลือง จีโนมสามารถช่วยให้ผู้เพาะพันธุ์พืชเข้าใจว่าไส้เดือนฝอยจัดการอย่างไร
เพื่อแทนที่การป้องกันของถั่วเหลือง
“สิ่งนี้ช่วยให้เราเข้าใจพยาธิสภาพพื้นฐานของหนอน” Baum กล่าว “ตอนนี้เราสามารถเห็นทั้งสองด้านของการแข่งขันทางอาวุธ ทั้งเกมรุกและเกมรับ”การเพิ่มประโยชน์ของจีโนม ทีม ISU ได้เผยแพร่งานวิจัยของพวกเขาใน ฐานข้อมูลออนไลน์แบบเปิด สำหรับนักวิทยาศาสตร์คนอื่น ๆ ในการเข้าถึง
Credit : เว็บสล็อต
